UCT Repository Prague MASTER THESIS

Příprava a strukturně funkční analýza retrovirové domény bohaté na glycin

Preparation and structural-functional analysis of retroviral glycine-rich domain

Bc. Zuzana Kůtová

UCT Repository Prague MASTER THESIS

Příprava a strukturně funkční analýza retrovirové domény bohaté na glycin

Preparation and structural-functional analysis of retroviral glycine-rich domain

Bc. Zuzana Kůtová

Na glyciny bohatá, 40 aminokyselinová doména, tzv. G-patch (GPD) se nachází v celé řadě buněčných proteinů, které se účastní sestřihu nebo transportu eukaryotických mRNA. Její přesná funkce však není známa. Překvapivě byla tato doména také nalezena u zástupce retrovirů, Mason-Pfizerova opičího viru (M-PMV). Deleční a mutační studie prokázaly nezbytnost GPD pro infektivitu M-PMV. Cílem této práce je produkce neradioaktivně metabolicky značené GPD v bakteriálních buňkách a nalezení účinného purifikačního postupu umožňující získat GPD o dostatečném m

The glycine-rich, 40 amino acid domain, called the G-patch (GPD), is found in a number of cellular proteins that are involved in the splicing or transport of eukaryotic mRNAs. However, its exact function is unknown. Surprisingly, this domain was also found in a representative retrovirus, Mason-Pfizer simian virus (M-PMV). Deletion and mutation studies have demonstrated the GPD requirement for M-PMV infectivity. The aim of this work is to produce non-radioactively metabolically labeled GPD in bacterial cells and to establish an efficient procedure for its purification to obtain GPD of sufficient quantity and quality suitable for structural-functional analyzes.

Advisor: prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc.
Ing. Radim Novotný
prof. Dr. Ing. Michaela Rumlová
Referee: prof. Ing. Kateřina Demnerová, CSc.
Thesis type: Master thesis
Institution: University of Chemistry and Technology, Prague
Faculty: Faculty of Food and Biochemical Technology
Department: Department of Biochemistry and Microbiology
Institution: University of Chemistry and Technology, Prague
Faculty: Faculty of Food and Biochemical Technology
Department: Department of Biochemistry and Microbiology
Study programme: Microbiology and Genetic Engineering
MŠMT code: N0511A130001
Language: Czech
Access rights: open access
SIS ID: 35142
Date available: Jun 15, 2021
Date modified: Jun 16, 2021
Date defended: Jun 1, 2021DEFENDED

Příprava a strukturně funkční analýza retrovirové domény bohaté na glycin

Preparation and structural-functional analysis of retroviral glycine-rich domain

Příprava a strukturně funkční analýza retrovirové domény bohaté na glycin

Preparation and structural-functional analysis of retroviral glycine-rich domain

ANOTACE

ANNOTATION